ESCOLA BRASILEIRA DE RMN - CURSO TEÓRICO-PRÁTICO DE DINÂMICA DE PROTEÍNAS POR RMN

PROFESSORES: Fabio Almeida (CNRMN-UFRJ) e Adolfo Henrique de Moraes (ICEx-UFMG), Ramon Pinheiro-Aguiar (CNRMN-UFRJ)

DATA: 12/06/2023 até 07/07/2023.

DIAS DA SEMANA: segundas-feiras, quartas-feiras e sextas-feiras.

HORÁRIO: 13:00 -17:00h

DATA LIMITE PARA A INSCRIÇÃO: 02/06/2023 (prorrogado)

LIMITE DE VAGAS: não há

VALORES: R$ 75,00 (sócios); R$ 300,00 (não-sócios)

PRÉ-REQUISITO RECOMENDADO: não há

OBJETIVOS: O objetivo deste curso é abordar os princípios básicos de relaxação do spin nuclear e o seu uso para a medida de dinâmica de proteína, ressaltando as aplicações e avanços científicos em biologia estrutural proporcionados pelo uso destes métodos. Introduzir os mecanismos e as funções de correlação e densidade espectral e a estratégia utilizada para as medidas de experimentais de relaxação e o tratamento teórico da dinâmica rápida (ps-ns) através do formalismo de Lipari-Szabo. Abordaremos a dinâmica de proteínas e outras macromoléculas em aulas práticas que fazem uso dos parâmetros de relaxação T1, T2, NOE e o tratamento teórico via Lipari-Szabo.

Serão abordadas as medidas quantitativas de dinâmica lenta (s-ms) através dos experimentos de dispersão de relaxação e transferência de saturação por troca conformacional (CEST). Abordaremos o tratamento teórico de troca química e conformacional utilizando a equação de Bloch-McConnell.

PROGRAMA

1. Introdução à relaxação do spin nuclear 
2. Equações de Bloch 
3. Equações de Solomons  
4. Função de correlação e densidade espectral. 
5. Mecanismos de Relaxação 
6. Efeito Nuclear Overhauser 
7. Parâmetros de relaxação - T1 e T2 
8. Troca quımica e conformacional/equação de Block McConnell. 
9. Dispersão de relaxação via CPMG 
10. Transferência de saturação via troca conformacional - CEST 
11. Lipari-Szabo model free formalism

CRONOGRAMA

• 12/06 (Seg) – Vetores e equações de Bloch (Fabio)
• 14/06 (Qua) – Introdução à relaxação (Adolfo)
• 16/06 (Sex) – Equações de Solomons (Adolfo) - NOE
• 19/06 (Seg) – Dinâmica rápida – pico a nano segundos (teórica) (Adolfo/Fabio)
• 21/06 (Qua) – Processamento de espectros (NMRPipe)
• 23/06 (Sex) – Dinâmica rápida – Lipari-Szabo (prática) (Ramon)
• 26/06 (Seg) – Dinâmica rápida – Lipari-Szabo (prática) (Ramon)
• 28/06 (Qua)- Dinâmica Lenta – micro a mili segundos (teórica) – R1rho/CPMG/ CEST (Adolfo/Fabio)
• 30/06 (Sex) - Dinâmica Lenta – micro a mili segundos (prática) – CPMG (Ramon)
• 03/07 (Seg) - Dinâmica Lenta – micro a mili segundos (prática) – CEST (Ramon)
• (data a definir) Avaliação – apresentação de papers